新品上市 | 罗氏诊断推出全新靶向富集解决方案——KAPA HyperPETE
靶向富集是靶向测序实验流程中最重要的一步，高质量的靶向富集试剂，全流程优化方案有助于获得高质量测序数据，提升测序效率。目前，基于探针杂交技术的靶向富集方案在灵敏度，特异性，均一性等性能方面得到普遍认可，但是探针法通常需要较长的孵育时间，从文库构建到靶向富集一般需要2天才能完成上机测序前的样本制备工作。随着NGS检测的快速发展，实验室检测的样本量日益增多，快速、简便的工作流程将成为趋势。有没有一种靶向富集技术可以兼顾性能和速度呢？
Yes！
KAPA HyperPETE解决方案！
KAPA HyperPETE采用创新的引物延伸靶向富集技术（Primer Extension Target Enrichment，PETE）（图1），专为较小目标区域（DNA<250Kb，RNA<50Kb）的靶向富集而设计，只需一天便可完成NGS样本制备。作为罗氏现有NGS产品的补充，KAPA HyperPETE工作流程整合了经验证的KAPA文库制备和KAPA靶向富集产品，提供从DNA或RNA样本到上机测序前的全流程配套试剂，释放每一个样本的潜能，加速NGS研究临床转化。
图 1. KAPA HyperPETE技术原理
（来源：罗氏诊断整理）
KAPA HyperPETE工作流程具有以下特点：
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基于罗氏多年的panel设计专业知识，解锁复杂基因组区域的变异检测
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可以检测多种突变类型：SNVs、Indels、Fusions（包括未知融合）、CNVs和MSI
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搭配KAPA Universal UMI接头使用，可以降低错误率
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经优化的工作流程，确保小panel具有出色的捕获性能
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孵育时间短，手动操作时间短，一天便可完成样本制备
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提供针对DNA和RNA应用场景优化的全套实验流程
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KAPA HyperPETE 目录Panel，设计更优
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依托罗氏积累多年的panel设计算法，KAPA HyperPETE提供五个目录panel：
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Panel名称 | Panel大小 | 详情 |
KAPA HyperPETE Hereditary Oncology Panel | 200Kb | 专注于遗传性乳腺癌和卵巢癌（包括 BRCA1 和 BRCA2）以及遗传性结直肠癌。涵盖这些癌症类型相关的 47 个基因。针对胚系变异研究提供高均一性和特异性的结果。 |
KAPA HyperPETE Newborn Screening Panel | 290Kb | 覆盖新生儿推荐统一筛查列表(Recommended Uniform Screening Panel,RUSP)首要筛查疾病相关的89个基因。针对胚系变异研究提供高均一性和特异性的结果。 |
KAPA HyperPETE Hot Spot Panel | 40Kb | 覆盖人类癌症基因中高频突变的基因组“热点”区域。可针对低质量、低起始量的FFPET DNA和cfDNA样本提供高均一性和特异性的结果。 |
KAPA HyperPETE Pan Cancer Panel | 302Kb | 覆盖1321个目标区域、86个癌症相关基因和190个MSI位点。可针对低质量、低起始量的FFPET DNA和cfDNA样本提供高均一性和特异性的结果。 |
KAPA HyperPETE LC Fusion Panel | 18Kb | 使用新型PETE技术检测已知/未知融合，包括17个肺癌融合基因（ALK、AXL、BRAF、EGFR、FGFR1、FGFR2、FGFR3、MET、NRG1、NTRK1、NTRK2、NTRK3、PDGFRA、PDGFRB、PPARG、RET、ROS1）和4个管家基因（RAB7A、VCP、CHMP2A、HPRT1）。 |
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针对不同的应用和样本类型，KAPA HyperPETE工作流程表现出优异的捕获性能和变异检出能力。
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KAPA HyperPETE Hot Spot Panel和KAPA HyperPETE Pan Cancer Panel检测血浆cfDNA样本结果：
图 2. 血浆和参考细胞系 cfDNA 性能数据
（来源：罗氏诊断整理）
表 1. 参考细胞系cfDNA变异检测性能
（来源：罗氏诊断整理）
KAPA HyperPETE LC Fusion Panel检测FFPET RNA样本结果：
图3. 组织RNA（FFPET）性能数据
（来源：罗氏诊断整理）
表2. 组织RNA（FFPET）的融合检测性能
（来源：罗氏诊断整理）
KAPA HyperPETE定制Panel
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性能出色的KAPA HyperPETE定制Panel，快速高效地覆盖目标区域
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依靠罗氏专有算法和久经验证的序列设计，提高目标区域覆盖度，提升数据利用效率。
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HyperDesign智能在线设计工具，只需四个简单步骤即可完成定制设计，还可在设计中选择添加已优化的MSI靶标，特殊设计需求亦可获得罗氏设计团队的专家协助。
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减少性能优化步骤，提高测序效率
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罗氏专业的panel设计和经过优化的KAPA HyperPETE工作流程，让您从第一次panel设计开始就享受高品质的产品和服务。
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